本病发病原因复杂，多种疾病或因素可导致男性不孕，根据精液检查结果，可分为无精症、重度少精症、少精症、精症正常性不孕、多精症、精症无力症等。
一般男性不育症的原因是
1、染色体异常常见的是男性假性双性畸形、Klinefelter综合征和XYY综合征、46XY/47XY等染色体异常导致睾丸生精障碍。
2、内分泌疾病下丘脑功能障碍，如Kallmann综合征，主要是促性腺激素释放激素不足的垂体功能障碍，如选择性黄体生成素(LH)缺陷症和尿促性素(FSH)缺陷症、高泌乳素血症等，肾上腺皮质增生症
3、生殖道感染 如前列腺炎，附睾炎，睾丸炎，尿道炎，严重者影响男性的生育能力。
4、输精管梗阻的先天性和后天性梗阻会影响精子的运输不育。
5、睾丸生精功能异常睾丸、睾丸、睾丸、病毒性睾丸炎、精索静脉曲张、毒素、磁场、高热和外伤等理化因素可引起睾丸生精障碍。
6、精子结构异常和精浆异常，影响精子运动，获得能量和顶体反应等。
7、免疫性不育男性自身产生的抗精子抗体和女性产生的抗精子抗体会影响精子的活力和卵子的穿透力。
8、男性性功能障碍勃起功能障碍、早泄、不射精和逆行射精都会导致男性不育。
9、药物因素:常见的有西米替丁、柳氮磺吡啶、雷公藤、螺内酯、呋喃西林、尼立达唑、秋水仙素、各种激素类药物和癌症化学治疗药物，如烷基化合物，往往会造成暂时或永久对精子的损害。
10、手术因素 如尿道瓣膜手术，尿道梗阻施行的膀胱颈部切开术，腹膜后淋巴结清除术或较大的腹膜后手术，均可能引起逆行射精或射精障碍，导致不育。
11、不良的生活习惯和工作因素，长期穿紧身衣，嗜烟和酗酒，接触有毒物质，频繁的热水澡，房事不当或频繁，经常长途或过度劳累，骑自行车或放射线受损等。
12、其他 纤毛滞动综合征，表现为病人在儿童时期就患有慢性呼吸道疾病，成年后其精子尾部纤毛异常，精子向前游动的能力弱。
