体外冲击波碎石可适用于肾、输尿管结石和膀胱结石。经过十几年的临床应用，体外碎石技术已被验证是一种创伤小、安全有效和使用方便的治疗尿路结石的理想方法，但是体外冲击波碎石还有一些禁忌症需要注意。
（1）结石以下有尿路梗阻：因碎石后结石无法排出；且由于结石碎石后容易堆积而加重梗阻，故解除梗阻前不能应用体外冲击波碎石治疗。
（2）不能治愈的出血性疾病及抗凝过程中的患者：因碎石过程中不可避免地会造成尿路的微小损伤，若已有出血性疾病，可能形成大的出血及出血不止。
（3）肾功能不全者：冲击波碎石可引起肾内微小出血、血肿及水肿，如肾功不全，又需多次碎石治疗，则容易加重肾功能损害。
（4）身体过分肥胖者：因肥胖导致腹围过大，使震波不能到达结石而影响治疗。
（5）急性尿路炎症者：急性尿路炎症可因碎石造成炎症扩散甚至败血症，可抗炎治疗后再作碎石治疗。
（6）孕妇。
（7）新发生的脑血管疾患，心力衰竭及严重心律不齐者。
（8）肝功能损害者。
（9）肾动脉硬化者。
（10）安置心脏起搏器者。
此外，严重骨关节畸形影响碎石体位的也不适宜。
