病情轻重悬殊是病毒性心肌炎最重要的特点之一。因此临床症状个体差异性很大，轻者可完全无自觉症状或症状较轻，重者可突然出现心源性休克或阿斯综合征。根据病程将其分为急性期、迁延期和慢性期3期。
(1)急性期:新发病，症状及检查阳性发现明显且多变，病程多在6个月以内。根据病情轻重分为轻、中、重3型。
①轻型:最常见。症状轻或无症状，主要为乏力、多汗、胸闷、食欲不振等。体格检查可发现面色稍苍白、心前区第一心音低钝，可有轻柔的收缩期杂音，心律不齐。
②中型:除轻型所表现的症状外，起病较急，乏力明显，年长儿常诉心前区痛。可伴烦躁不安、恶心呕吐等症状。体格检查可发现面色苍白、呼吸急促;心界正常或略增大，心音明显低钝，有时可闻及奔马律，心动过速或过缓，可有心律不齐。血压可下降，脉压较小;肝脏增大，有压痛。
③重型:呈暴发型，起病急骤，1～2天内出现心功能不全或心源性休克。病情进展迅速，可在数小时至数日内死于急性心力衰竭、心源性休克或严重心律失常。患儿极度疲乏、头晕、烦躁，年长儿诉心前区痛，软弱无力、手足冰凉。体格检查可发现面色苍白、口唇发绀、四肢厥冷、脉搏细弱;心音低钝，心尖区第一心音极低钝，可闻及收缩期杂音，常有奔马律及心动过速、过缓或严重的心律失常。
(2)迁延期:急性期之后临床症状反复出现，心电图及X线检查客观指标迁延不愈，心肌酶学检查有活动的表现，病程多在半年以上。
(3)慢性期:病情反复，时有加重，进行性心脏增大或反复心力衰竭，病程在1年以上。多见于较大儿童。临床上以慢性充血性心力衰竭为主，其表现类似扩张型心肌病。
