1、引起肛肠疾病。便秘时，排便困难，粪便干燥，可直接引起或加强肛肠疾病。如直肠炎、肛裂、痔疮等。
2、肠胃神经功能紊乱。便秘时，粪便会积存，有害物质的吸收会导致胃肠神经功能紊乱，导致食欲不振，腹胀、嘎嘎、口苦、肛门排气多等表现。
3、形成粪溃疡。较硬的粪块压迫肠腔使肠腔狭窄及盆腔周围结构，阻碍了结肠扩张，使直肠或结肠受压而形成粪便溃疡，严重者可引起肠穿孔。
4、患结肠癌。可能是因为便秘导致肠内致癌物长期无法排除，据资料显示，严重便秘者约10%患结肠癌。
5、诱发心、脑血管疾病的发作。临床上便秘加强腹压，屏风排便引起的心脑血管疾病的发作有逐年增加的倾向。如诱发心绞痛、心肌梗塞发作、脑出血、中风猝死等。
6、引起性生活障碍。这是因为每次排便时间长，直肠疲劳、肛门收缩过紧、骨盆底部痉挛性收缩，不射精或性欲减退，性生活没有高潮等。
7、容易引起女性痛经、阴道痉挛、尿积、尿路感染等症状。
8、影响脑功能。便秘时代的谢物长期滞留在消化道上，细菌的作用产生大量有害物质，如沼气、酚、氨等，这些物质部分扩散进入中枢神经系统，干扰大脑功能，突出表现是记忆力下降，注意力分散，思维迟钝等。
