芡实副作用可能会出现上火或消化不良等，禁忌症包括便秘、腹胀、脾胃虚弱、幼儿及产后孕妇等。
芡实味甘，涩。如果长期服用可能会因其药性固涩，引起食用者出现上火等症状，并且芡实中所含物质较难消化，可能会造成消化系统负担，使正常营养物质的吸收受到阻碍，引起食欲下降、恶心呕吐等症状。
芡实性质较固涩收敛，对于因内热或外感热邪所致的大便干结便秘患者应忌食，并且如果一次性进食过多时，对于脾胃虚弱患者，其胃肠道消化能力较弱，会导致消化不良、腹胀等症状，应适量减量或忌食芡实，并且对于产后一个月的孕妇或婴幼儿，孕妇因其身体虚弱，脾胃运化能力不足，婴幼儿则因消化系统尚未完善，无法对芡实有效消化，均需忌食芡实。
