正常的肠道菌群是人体健康的守护神，是人体所必需的微生物群，它们对人体健康的主要贡献有以下四个方面：
①帮助消化食物和吸收营养(包括蛋白质、糖、脂肪、铁、钙及维生素D，合成维生素B、C、K、烟酸和叶酸等)，维持正常的肠道运动。
②促进机体免疫，由双歧杆菌、乳杆菌等组成的膜菌群通过占位保护、产生细菌素、有机酸、过氧化氢等物质，阻挡或抑制致病菌或条件致病菌侵袭肠黏膜产生非特异性免疫效果，肠道菌群作为抗原可刺激和促进免疫系统的发育和其功能的成熟，使机体获得对许多致病菌及其毒素的抵抗能力，发挥特异性免疫功效。
③在菌群平衡的情况下，抑制肿瘤的发生和发展。双歧杆菌等有益菌能将亚硝酸胺降解为亚硝酸盐与胺，起到抑癌作用，而大肠杆菌、梭状芽胞杆菌、肠球菌、拟杆菌等能促使食物中的亚硝酸盐与胺结合成具有较强致癌作用的亚硝酸胺。所以肠道菌群是促癌还是抑癌，关键取决于哪些菌群占优势。健康状态下抑癌的菌群占优势，所以主要发挥的是抑癌作用。
④在菌群平衡情况下，肠道菌群能减少胆固醇的吸收，降低血液中内毒素的浓度，具有抗衰老的作用。
