肠道肿瘤和肠道炎症等肠道器质性病变会对正常的排便产生影响，严重了就会导致便秘。直肠和肛门病变以及各种内分泌或代谢性疾病也是导致便秘的常见疾病。除此之外，便秘的发生和结肠神经肌肉病变以及各种免疫系统性疾病也有一定的关系。
1.肠道器质性病变：各种肠道器质性病变可导致便秘，比如说发生在肠道的肿瘤和炎症。不管是肠道肿瘤还是肠道炎症，都会使肠腔变得狭窄，甚至还会发生梗阻，这样一来，粪便在肠道内的空间会明显缩小，排便的时候自然要费力，严重了就会导致便秘。
2.直肠和肛门病变：直肠和肛门病变也容易导致便秘。在生活当中，患有直肠和肛门疾病的人不在少数，较为常见的就是直肠内脱垂和痔疮，再就是直肠前膨出和盆底病等疾病，这些直肠和肛门的病变都会在一定程度上影响到大便的正常排泄，久而久之就形成了便秘。
3.内分泌或代谢性疾病：便秘的发生和某些内分泌或代谢性疾病有关系，比较常见的就是糖尿病和甲状腺功能低下，也有可能是甲状旁腺疾病引起。这些内分泌或代谢性疾病容易引起内脏神经损伤，也会影响到肠道的正常功能，使肠道的蠕动能力减弱，久而久之就形成了便秘。
4.结肠神经肌肉病变：结肠神经肌肉病变也会导致便秘，比如说结肠冗长和巨直肠，再就是假性肠梗阻先天性巨结肠。这些都属于是先天性的疾病，很容易引起排便障碍，如果没有及时地进行治疗，患上便秘的几率会大大地增加。
5.免疫系统性疾病：很多的免疫系统性疾病也会引发便秘，比如说系统性红斑狼疮和硬皮病。这些免疫系统性疾病会导致自身的免疫功能发生紊乱，正常的细胞被损伤和破坏，进而影响到身体多个系统和器官，其中也包括消化系统，进而引发各种消化系统疾病，便秘就是其中之一。
