花蛤蜊的营养丰富，100克（可食部分为46克）花蛤蜊中，蛋白质7.7克；脂肪0.6克；碳水化合物2.2克；胆固醇22毫克。由此可见花蛤蜊的营养特点是高蛋白，且氨基酸的种类组成及配比合理；低脂肪，不饱和脂肪酸较高，易被人体消化吸收。还含有磷、钙、镁、铁、锌、硒等多种人体必需的微量元素，维生素A、维生素E、维生素B2各等种维生素和药用成分。
花蛤蜊肉含一种具有降低血清胆固醇作用的代尔太7—胆固醇和24—亚甲基胆固醇，它们兼有抑制胆固醇在肝脏合成和加速排泄胆固醇的独特作用，从而使体内胆固醇下降。它们的功效比常用的降胆固醇的药物谷固醇更强。所以花蛤蜊汤特别适合高胆固醇、高血脂体质、患有甲状腺肿大、支气管炎、胃病等疾病的人食用。花蛤蜊入药还有降血压的作用，建议三高病人可以多吃。
人们在吃完花蛤蜊后，常有一种清爽宜人的感觉，有益于解除一些烦恼症状。要注意的是花蛤蜊要熟了才能吃。有宿疾者、对海鲜过敏者应该慎食花蛤蜊汤。由于花蛤蜊性寒凉，一些脾胃虚寒者不宜多吃。
