甲状腺功能减低症的症状出现的早晚及轻重程度与残留甲状腺组织的多少及甲状腺功能低下的程度有关。先天性无甲状腺或酶缺陷患儿在婴儿早期即可出现症状，甲状腺发育不良者常常在出生后3-6个月时出现症状，偶有数年之后才出现症状的，其主要特点有三:智能落后、生长发育迟缓、生理功能低下。
先天性甲低不能治愈。先天性甲低，即先天性甲状腺功能低下(CH)，是儿童时期常见的智残性疾病，早期无明显表现，一旦出现症状，是不可逆的，又称呆小病，此病迟发现对儿童智力发育影响很大，此病可导致身材矮小，智力低下，医学上一般认为如果在2个月内发现，及时治疗，终身服药，智力基本正常。大于10个月发现、治疗的，智商只能达到正常的百分之八十，大于2岁发现的，智力落后不可逆。先天性甲低发病率大约是五千分之一。先天性甲状腺功能低下症临床表现为智力迟钝、生长发育迟缓及基础代谢低下。
除了少数患儿是暂时性甲减，可以停药外，多数先天性甲减都是不能治愈的，治疗原则是早期诊断，早期治疗，终身服药。目的是尽快恢复正常的甲状腺功能，治疗越早，对小儿的身高发育，智力发育影响越小。
