肝脓肿的分型包括细菌性肝脓肿，阿米巴性肝脓肿，真菌性肝脓肿。
1、细菌性肝脓肿
细菌性肝脓肿是由化脓性细菌所引发的肝内感染，较常见的革兰氏阴性菌和厌氧菌。感染途径主要是胆道感染，可从胆道感染直接蔓延至肝脏。也有可能是腹腔内其他脏器感染，后经门静脉进入肝脏。此外，全身各个部位的感染经肝动脉进入肝脏也会引发细菌性肝脓肿。
2、阿米巴性肝脓肿
阿米巴性肝脓肿指由阿米巴原虫所引发的肝脓肿。阿米巴原虫可从结肠阿米巴溃疡经门静脉系统进入肝脏，在肝脏当中溶解组织，最终形成脓肿。随卫生条件改善，阿米巴性肝脓肿发病率有所降低。
3、真菌性肝脓肿
真菌性肝脓肿是由真菌感染所致肝脓肿，免疫力低下及滥用抗生素的人较易患上该病。不过真菌性肝脓肿临床较少见，发病率不足10%。
