慢性肠炎多因不洁东西所引起，故预防最要紧的是食物之清洁及保存安全。小孩尽量不要吃街上贩卖的生冷东西，在家中吃东西要煮沸以及用其他方法洗净消毒灭菌。食器亦要消毒干净，婴儿所有奶瓶、奶头都要严格消毒，冲好的奶或吃过一半的奶，不可放置在温室太久。家里有下痢人时，应将病人隔离，其大便呕吐等排泄物的用具要消毒，排泄物要小心处理，以免传染给其他小孩。
总之预防肠炎应注意以下六点：
一、注意家户卫生、装纱窗、扑灭苍蝇、蟑螂，以及环境清洁。
二、避免带小儿到公共场所。
三、避免吃生冷不洁东西。
四、小儿之食器注意安全及清洁。
五、隔离病人及小心处理其排泄物。
六、个人卫生及卫生教育，尤其带小孩的人，要常常洗手，给小儿换尿布以后即要洗手;在接触小儿泌物后亦要洗手，以免细菌传染给小儿。
