第一，诊断明确。包括西医诊断中脂肪肝的分类、分期、分型、分度和中医诊断中的分辨型。如果诊断不明确，就不能抓住主要矛盾，不能急救标准、缓治本、标本兼治，也不能发挥整合疗法的优势，影响治疗效果，因此西医诊断与中医辨证相结合。
第二，治疗方案随证变化。脂肪肝病理状态相对固定，但治疗中的证据型不断变化，治疗法则应相对灵活。常用的治疗法则有疏肝、利胆、健脾、胃、补肾、活血、理气、化痰、利湿、清热，这些治疗法则应根据患者和疾病所处阶段的不同，抓住主要矛盾，结合经络、穴位治疗，引进药物治疗和口服中西药物治疗，与食疗、体疗有机整合，制定最佳治疗方案。
第三，综合判定疗效。治疗前后应考虑影像学的变化(超声波或ct)、血生化指标(肝功、血脂)、症状体征三个指标。一般来说，只要一个指标明显改善，其他两个也会改善，有时临床表现不同步。
第四，合理应用。对于不同的患者，需要采用不同的强度、配孔、引进处方和体位、循环手法，这在临床上很讲究，必须因人生病治疗。医生要认真与患者沟通，做好记录，经过一周左右，找出适合该患者的最佳组合方案。
第五，患者积极配合。脂肪肝的治疗必须与医生密切合作，戒酒，改变不良生活习惯和饮食习惯，对提高临床疗效有很大关系。门诊治疗无法控制患者的饮食，患者配合不良疗效大幅度降低。
第六，坚持治疗。脂肪肝就医的患者大部分是在职者，由于各种原因很难继续治疗。此时可利用家用型肝病仪在家治疗，定期复查。医生要帮助患者克服急于求成的心理。
第七，注意个人差异。一般仪器治疗气感强的患者疗效好，钝型或敏感体质的患者疗效差。中青年患者疗效好，老年患者疗效差。单纯性脂肪肝患者疗效好，合并有糖尿病、高血压、肾病等慢性病患者疗效差。有家族聚集史的患者疗效差。
