肠息肉一般没有临床症状，即使有，症状也没有特异性，因此肠息肉的确诊主要依赖于特殊的器械检查。临床上常用的有各种消化道内镜、x线消化道造影、CT扫描等。
1、电子肠镜:这是肠息肉最主要的检查方法，实际上大部分肠息肉在肠镜检查中偶然发现。结肠镜从肛门置入，可以检查全部结肠以及终末端的小肠（末端回肠）。在肠镜下，可以清楚地观察肠道的粘膜面，对隆起的息肉非常敏感，可以发现几毫米以下的息肉。随着消化内镜技术的不断进步，医生不仅可以发现结肠息肉，而且可以发现息肉，而且能够对息肉的类型进行初步判断。对于结肠息肉来说，最重要的是鉴别具有癌变倾向的腺瘤性息肉和不会癌变的非腺瘤性息肉。日本医生工藤提出了结肠息肉分型方法，已经广泛应用到临床。根据这种分型，在染色内镜、放大内镜等先进技术的帮助下，医生可以通过内镜比较准确地判断息肉的类型，进行相应的治疗。在肠镜下，可通过活检确诊息肉的病理性质。结肠镜检查不仅仅可以诊断息肉，而且是治疗息肉的重要手段。
2、胶囊内镜和小肠镜：小肠息肉非常罕见，常常因为腹痛或便血等症状在进行胶囊内镜或者小肠镜检查中发现的。胶囊内镜是检查人员口服内置摄像头和信号传输装置的智能胶囊，在消化道内运动拍摄影像进行肠道检查的方法，主要用于诊断小肠疾病。胶囊内镜检查患者无痛苦，对大多数患者完成小肠粘膜的观察，对小肠疾病的诊断具有重要价值。小肠镜与结肠镜类似，可以观察小肠黏膜，并且可以对病变部位进行活检，确定诊断。
3、x线消化道造影:以硫酸钡为造影剂，在x线照射下显示消化道有无病变的检查方法，主要有消化道钡饮食检查和钡灌肠两种方法。消化道钡饮食检患者口服硫酸钡，主要用于检查食管、胃和小肠，钡灌肠时医生将硫酸钡从肛门灌入，主要用于检查结肠。x线检查只能发现一部分比较大的息肉。但是相对消化内镜检查，优点是安全，并发症少，而且病人因检查带来的不适比较轻微。
4、其他：随着临床诊断技术的不断进步，现在还出现了CT仿真结肠镜，正电子发射断层扫描（PET）等技术，也可以发现比较大的肠息肉。对息肉的性质作出不同程度的判断。
