药物流产药物米非司酮的剂量仅为原剂量的1/4~1/3，副作用不明显，主要是加重早孕反应和疲劳。前列腺素的副作用主要是胃肠道反应，如恶心、呕吐、腹泻和子宫收缩引起的下腹痛。其他人有发烧、头晕、皮肤发红和麻木等症状。
为预防或治疗胃肠道副作用，可在用药前后服用复方苯乙呢陡或胃复安，严重腹痛可给予冷丁或阿托类镇痛解痉药。但避免使用抗前列腺素的抗炎、氟灭酸或水杨酸制剂。少数孕妇服用米非司酮流产。
80%的孕妇在使用前列腺素类药物后6小时内排出绒毛胎囊；约10%的孕妇在服药后1周内排出。因此，只要有出血，就要注意排出物。如果组织在家中排出，必须带医生检查是否有绒毛组织。
根据绒毛胎囊的排出或未排出，在用药后8~15天内到医疗机构确定药物流产的效果。医务人员确定药物流产失败或不完全的，必须进行人工流产以终止妊娠。
虽然绒毛胎囊在药物流产过程中已经排出，但子宫内的蜕膜组织排出缓慢，因此出血时间较长，平均为18~20天。有些妇女会因出血多、时间长而贫血或并发子宫内膜炎、盆腔炎等。因此，药物流产必须到具有急诊刮宫手术和输液等的医疗机构，在专门培训的医生筛选指导下应用，并按规定服药、观察、随诊，以便及时发现问题，及时处理。
