非淋菌性尿道炎患者和病原体携带者是本病的传染源，要预防本病，就要切断它的传播途径，本病可通过下面三种途径传播。
1、直接性接触感染。与患非淋菌性尿道炎的患者性交时，可被传染。男性患非淋菌性尿道炎，可通过性交传染给女方；25%～50%患有衣原体性宫颈炎的女性，可经性交传给男方。
2、间接接触感染。使用患有非淋菌性尿道炎的患者用过的衣裤、床上用品、毛巾、浴盆、抽水马桶、便器等，可被传染。
3、产道感染。患有非淋菌性尿道炎的产妇通过产道感染新生儿，妇产科医生和母亲的手指也可将病原体带给新生儿。胎儿在子宫内也可发生感染。
其中，性接触是非淋菌性尿道炎最主要的传播方式。因此，要预防非淋菌性尿道炎，须做到：
1、避免男女双方的不洁性交，避免婚外性行为。
2、提倡使用避孕套。
另外，平时要注意清洁卫生，勤洗手，注意贴身衣物和日常生活用具的消毒。不要与他人共用盆、毛巾等，以避免间接感染。女性患阴道炎后应及早治疗。
预防的关键是杜绝不洁性交。此外，公共浴堂的卫生也很重要，不与别人共用洗阴部的毛巾、盆具，不混用内衣裤。家中有婴幼儿者，要严格物品及手的消毒，以防通过密切接触传播。
淋病加大了“非淋”发病的机会，故患淋病后要积极治疗，彻底治愈。淋病治愈后要化验检查是否患有非淋菌性尿道炎。
