影响精子形态，导致精子畸形的机制尚未完全清楚，但总体而言主要包括微生物因素、理化因素和内分泌因素等几个方面。
微生物因素。男性生殖道和射出精液中均可见白细胞。精液中白细胞浓度增高可导致精液质量下降。另外，细菌、支原体、衣原体、病毒等也可致使精液发生感染，可导致精液质量(活力、pH、形态)改变。
环境变化包括空气污染、职业接触、生活习惯等可影响精液质量。工作环境对精液质量也有显著影响。各种毒性物质接触史是导致男性生育力降低的重要因素。长期接触农药(如杀虫剂)对精子形态也有显著影响，导致形态正常精子率显著降低。此外，一些药物(如抗生素、抗癌、抗躁狂药)也可导致男性精液中形态异常精子率增高。
内分泌因素。正常男性精浆中，雌激素水平显著高于血清雌激素水平。这既表明雌激素的局部产生，也暗示睾酮/雌激素的平衡对正常男性精子发生起重要作用。
要保护好精子，降低畸形率，汪中扬强调除减少烟酒危害、控制房事次数、保持阴囊适温、防止药物损害、注意劳逸结合、加强身体锻炼外，还应注意生活环境，合理调整饮食，多吃一些含精氨酸类食物，如大豆及其制品、鳝鱼、墨鱼、章鱼、山药、银杏、西瓜、南瓜等。
