一般情况下，连花清瘟胶囊可以和氨基酸一起吃，不会影响药物的治疗效果。具体分析如下：
氨基酸是合成蛋白质的基本单位，氨基酸类药物的常用剂型为注射剂。连花清瘟胶囊通常可以和氨基酸一起吃，因为连花清瘟胶囊是一种中成药，主要成分是连翘、金银花、炙麻黄、炒苦杏仁、石膏等中药材，具有清瘟解毒、宣肺泄热等功效，可以用于治疗流行性感冒引起的发热、恶寒、肌肉酸痛等病症，但是一般不会影响蛋白质的摄入和合成，所以这两种药物可以一起使用。
