克罗恩病经常发生于中青年，目前认为，克罗恩病不会对患者的生育能力造成显著影响(包括男女性)，但是服用柳氮磺胺吡啶与雷公藤的男性患者可能面临精子的数量减少、活性降低等风险。
在怀孕期间，诱导维持克罗恩病缓解非常重要，也是决定分娩成败的关键因素。研究发现，怀孕期间如果合并克罗恩病处于活跃期，则早产与低体重儿的风险显著升高。
目前用于克罗恩病治疗的多数药物均可在怀孕期间服用，除了甲氨喋呤(methotrexate)与沙利度胺(thalidomide)，TNF单抗(如英夫利昔单抗)也应当在孕期6个月之前停用。
总结，在怀孕前及怀孕期间均应当始终维持克罗恩病缓解，且选择克罗恩病药物时需谨慎，这些也是克罗恩病患者分娩成功与否的关键。
