跑步后肚子痛可能是因为跑步岔气、呼吸不当而引起的腹痛，也有可能是胃肠疾病导致的腹痛。
1.岔气：岔气又称急性胸腹部疼痛，造成岔气的原因是剧烈活动之前准备活动不够或未做准备活动。剧烈活动时肌肉进入紧张状态，而内脏器官不能马上活动起来，以满足肌肉活动时所需要的养料和氧气，使呼吸肌紧张而痉挛。
2.呼吸不当：当跑步感觉到疲惫时，用嘴大口的吸气，这样不仅容易引起肚子疼、咳嗽，而且也非常容易疲劳，应当用鼻子慢慢地吸气，然后再跑两三步，用嘴尽力向外吐出废气。这样有节奏的呼吸，跑起来自然就会轻快，也不会引起腹痛。
3.胃肠疾病：右上腹部疼痛时主要考虑有胆囊炎、胆结石、肝脓肿、肝癌等疾病。左上腹疼痛时，考虑有胰腺炎的可能，肺炎或胸膜炎时也可以出现上腹部疼痛。中腹部两侧或者脐周疼痛时，要考虑有慢性肠炎、溃疡性结肠炎、克罗恩病等。右下腹疼痛特别是急性发作时，有阑尾炎及输尿管下段结石的可能性。
