细菌性肠炎和病毒性肠炎属于两种不同的肠道疾病，可以从病情临床表现、发展程度、发生的季节进行鉴别。
一般由细菌感染造成，潜伏期时间为数小时到5天。症状为腹泻、腹痛、稀水样便等，会有脓血样便并且臭味比较重，病情发展比较缓慢。症状会持续1天到2天，一般常发生在夏秋季节。治疗原则一般以到抗生素治疗为主。
一般由轮状病毒感染引发的急性胃肠道传染性疾病，感染后1到3天开始出现肠胃炎症状，症状可持续1~10天，最常见的为轮状病毒性肠炎。主要临床表现为高热、恶心、呕吐、腹泻，一般腹泻较重等，病情发展很快。常发生在秋冬季节。治疗原则一般以对症支持对症治疗为主。
