马方综合征病情凶险，预后较差，患者平均年龄在40岁左右，具体生存期则与合并并发症种类、治疗方案等因素。
1、合并并发症种类
马方综合征常合并神经系统病变、眼部病变、先天性心血管病变等并发症。合并神经系统病变、眼部病变，病情较轻患者生存期较长；而合并主动脉夹层、心脏瓣膜异常等先天性心血管病变，则病情较为凶险，致死率过高，生存期有限。
2、治疗方案
马方综合征无确切性治疗方案，以内分泌治疗、药物治疗、手术治疗为主，而治疗目的以改善局部症状，减少并发症危害为主，若是采取内分泌治疗、药物治疗等保守性治疗方案，疗效有限，患者生存时间较短；采取手术治疗，患者生存期相对较长。
