过山洞耳朵不舒服是因外界压力和中耳内部压力失去平衡，或因咽鼓管功能异常所致。
中耳是通过咽鼓管结构和鼻咽部进行连通，在过山洞、隧道时，耳朵内外气压会随之改变，外界压力会将鼓膜压向中耳腔，当中耳与外界压力不平衡时，咽鼓管可以打开，调节外界的压力保持平衡，所以导致耳朵出现听力下降、闷胀感。
本身咽鼓功能较差，患有炎症疾病者，更易出现耳朵闷堵症状，一般在做吞咽动作，或嚼口香糖时可以缓解。若出山洞后，耳朵闷堵症状持续几天仍未缓解，需进行听力和耳压检查，确定有无炎症影响，并考虑应用消炎药物、促排类药物缓解，如地塞米松、红霉素、头孢唑肟类抗生素，或应用氧氟沙星滴耳液、过氧化氢溶液类药物。
