一般情况下，偶尔吃一次紧急避孕药对身体无太大影响。若频繁性服用会导致女性月经不调、排卵周期紊乱等问题。
紧急避孕药为高效孕激素，能够控制卵巢排卵，打破卵巢原有自然规律，而孕激素会促使内膜增厚，服药后，可能会出现撤退性出血症状。
其次紧急避孕药会影响女性体内蛋白、糖、脂肪正常代谢，造成血压增高、动脉硬化、凝血功能失常，或诱发血栓性疾病，但其代谢较快，正常3天可从体内代谢，吃一次对身体的影响不大。
