治疗跖疣没有最佳方法，需根据患者的病情进行选择，常用的治疗方法有物理治疗、外用药物治疗。
常见的方法有冷冻、电灼、刮除和激光等，这些都是有效的方法，若是皮损数目多，可以分批分次进行治疗。
对于不宜进行物理治疗的患者，可根据患者自身的情况进行外用药物治疗。常用的药物包括水杨酸、二甲亚砜溶液、0.05％～0.1％维A酸软膏、氟尿嘧啶软膏、5％咪喹莫特软膏。需要注意的是，患者的用药需要在医生的指导下进行，不能擅自用药。
