药物流产的应用于临床已有十多年的历史，不良反应在近年逐渐反应出来，容易导致女性不孕，原因如下：
1、药物流产终止早期妊娠效果是肯定的，成功率是对用药后其孕囊是否完全排出而言， 药物流产时蜕膜从宫腔内排出需要较长时间，一方面阴道流血时间增加感染机会，另一方面脱膜残留在宫腔增加了组织碎屑阻塞输卵管的机会。有很多输卵管感染可无明显症状，盆腔检查也大都正常，易漏诊而治疗不及时，使输卵管发生慢性炎症造成阻塞引起不孕。
2、对药物流产后子宫刮出物进行组织学检查，发现有80%伴有不同程度的炎症细胞浸润，提示子宫出血时间长，可能诱发子宫内膜炎，药流后继发不孕的主要原因是输卵管梗阻，造成输卵管堵塞的原因是炎症，而炎症的发生又与流产的并发症密切相关。
3、药物流产后阴道出血时间过长或组织残留宫腔感染;药物流产前生殖道已有炎症，特别是支原体、衣原体感染，导致输卵管黏膜的炎症、粘连或周围瘢痕组织的牵拉屈曲改道或闭塞，表现为输卵管通畅障碍和蠕动机能紊乱，以至于输卵管梗阻，使卵子与精子无法会合而引起不孕。
