对于大多数单纯的眼皮跳跃的人来说，最常见的原因是眼睛过度或疲劳，精神过度紧张，如电脑时间过长强光或弱光下眼睛过长、考试前精神压力过大等。另外，眼睛屈光不正、近视、远视或散光，眼内异物、倒睫、结膜炎、角膜炎等也会引起眼睑跳跃。
人的眼睑有两种肌肉，一种叫做眼轮肌，形状像车轮，环绕眼睛，收缩时眼睑闭合，这种眼轮肌被脸神经支配。另一种眼睑肌肉被称为提高眼睑肌肉，收缩后眼睑开放，这种肌肉被眼神经所支配。在眼睑的这两种肌肉组织中，眼轮肌对保护眼球有重要作用，通过不断闭合润滑和清洗角膜，对外部刺激发出保护性反应。
引起眼睑跳跃的疾病，病理性眼睑跳跃的原因很多。常见的是睫毛、结膜炎、角膜炎、眼外伤、脑炎、脑血管疾病等，贝尔麻痹(单纯周围面神经麻痹)、肌肉张力障碍、痉挛性斜颈、多发性抽动症等，有些患者与遗传因素有关。
此外，脑肿瘤和动脉硬化可能刺激面部神经，引起眼部和面部激烈反应。因此，从某种意义上讲，眼皮跳跃也是人体健康和心理状况的警报器，特别是长期眼皮跳跃必须警惕脑内是否有病变。
很多人只限于上眼睑和下眼睑的跳跃，但也有发展为上下眼睑的持续抽动的人。支配眼睑肌肉的面部神经在传导通道的任何部位都会受到刺激，眼睑的跳跃、神经受到刺激的部位不同，眼睑的跳跃部位、跳跃范围和程度也不同。
刺激因素仅限于支配眼轮肌的神经末梢，即眼睑附近，表现出的症状是单纯的上眼睑和下眼睑跳跃。受刺激的部位在脑腔内的脸神经干部的话，跳跃范围会牵累上下眼睑整体，最直观的表现是不由得眨眼，医学上被称为眼睑痉挛。
如果眼皮持续跳跃，没有消失的意思，请注意。这种类型的眼皮跳跃多为病理性，可能是额头、头内或全身性疾病的临床症状，属于许多身体症状之一。眼果眼睑跳跃不能自行缓解，甚至持续恶化，导致同一侧面部颤抖或抽动，应及时就医，并告知医生相应的情况以便进一步诊断和治疗。
