1、正颌手术具有一定的风险性和不可预测性，可能会出现危及生命的严重并发症。
2、由于各人审美观不同，医生身体条件差异和现行医疗技术有限，手术效果不一定能满足医生的要求，也有可能出现不理想或并发症的手术非常成功的情况下，患者和家不被认可，因此患者和家人在手术前与医生充分沟通，对正颌手术的效果保持清晰的认识。四川大学华西口腔医院口腔颌面外科罗恩
3、正颌手术通常通过口内渠道进行，但部分病例和特殊情况必须通过脸部切口进行。手术部位会留有瘢痕，瘢痕大小与患者本人体质有关，多数患者的瘢痕增生会在一年左右减轻，但个别患者有严重瘢痕疙瘩形成的风险，且难以消退。
4、术后有手术部位肿胀、不适等情况出现、有一定的恢复期，根据个人年龄、体质、手术部位和类型的不同而恢复时间长短不一样(一般情况1-3月，个别可达1年以上)。
5、人体面部两侧并不完全对称，因此手术也不可能使两侧达到完全一致。
6、手术是一种创伤性治疗手段，具有风险，一般安全，但由于手术方式和个人差异等多种因素的影响，手术中和手术后可能会发生意外情况和并发症，如出血、感染、意外骨折、附近器官和软组织损伤等。
7、正颌手术需要切断颌骨并在正常的位置重新固定。固定需要钛板钛钉，少数人可能有术后排异反应、感染和断裂等风险，需要取出或重新手术。
8、术中存在面部神经、下颌关节、着名血管等重要组织器官损伤的风险，术后可能出现抬不起眉头、闭不上眼睛、鼻唇沟变浅、眼眶区和嘴唇皮肤麻木、面部不对称、咬合、语言功能障碍等症状。轻者在3~6个月内自行恢复，重者需要进一步进行相关治疗，甚至可能无法完全恢复。
9、上颌手术可能会改变鼻部软硬组织结构，导致鼻中隔偏曲、鼻翼变宽、鼻高改变等，必要时需再次手术矫正。
10、正颌手术可改变脸部骨骼结构，软组织也相应改变。但是，这些术后容貌的变化不一定符合患者和家人术前的期待和要求，术后整形效果有逐渐接受和适应的过程。
