早晚咳嗽需针对病因选择合适方法治疗，环境药物因素所致的应避免接触不良诱因，炎症感染者需口服止咳消炎药治疗，过敏性疾病所致应服用止咳药和抗组织胺药治疗。
对于受到环境或药物刺激所致的早晚咳嗽，一般及时解除诱因即可。建议要远离不良环境，尽可能待在湿度适宜和干净的环境中，且应暂停服用血管紧张素转化酶抑制剂、抗心律失常药物和抗肿瘤药等可引起咳嗽的药物。
若是肺部或支气管等部位受到炎症感染，如患上肺炎或支气管炎，会引起早晚咳嗽，患者需服用止咳镇咳药和消炎抗菌药治疗，常用药有镇咳宁糖浆、复方甘草口服溶液、阿莫西林胶囊等，以及时缓解咳嗽症状，消除局部炎症。若炎症较严重，如已引起脓胸等症状，则要及时行外科手术。
哮喘等过敏性疾病会导致早晚咳嗽，此时一定要及时查找并远离可能的过敏原，如花粉或动物皮毛、粉尘等物质。患者除了要服用复方甘草片、强力枇杷露、苏黄止咳胶囊等止咳镇咳药缓解外，还要搭配服用抗组织胺类药物，如氯雷他定片、氯雷他定糖浆等，可尽快促使自身免疫功能恢复，及时消除过敏性反应。
