单纯疱疹病毒可能导致胎儿流产、胎停、发育畸形、患先天性疱疹病毒感染性疾病等，具体影响与怀孕时间有关。
怀孕早期正是胎儿分化的关键期，如孕妇感染单纯疱疹病毒，病毒会影响胚胎发育，导致胎儿出现先天性发育畸形，如唇腭裂、先天性心脏病、无脑儿等。还可能会导致胎停、自然流产等。
怀孕中期感染单纯疱疹病毒对胎儿的影响与疾病类型有关，如孕妇感染一型疱疹病毒，注意补充营养，适当锻炼身体，增强抵抗力，可自行消除病症，一般对胎儿发育影响不大。如感染二型生殖器疱疹，有可能会影响胎儿发育，导致胎儿发育畸形。
在怀孕后期感染单纯疱疹病毒时，病毒经胎盘进入胎儿体内，可能引起先天性疱疹病毒感染。病毒还会经产道分娩时进入新生儿体内，导致新生儿出现脑炎等疾病，严重时还可能导致死亡。临床数据显示，孕期感染单纯疱疹病毒后，胎儿死亡率能达到70%-80%。
