卵巢疾病的发病原因，与疾病的具体类型有关。卵巢炎是由不良的生活习惯或感染所致；多囊卵巢综合征的发病原因主要是下丘脑垂体功能失常和遗传；卵巢早衰也可由遗传引起，同时也与长期抽烟喝酒有关。
卵巢炎多因患者不良的生活习惯所致，如平时不注意经期卫生以及性生活卫生、性交过于频繁等，会造成病原菌逆行感染，使卵巢局部出现炎症反应。足月分娩或人工流产后，抵抗力下降，若不注意护理，病菌会经阴道进入子宫和盆腔，导致卵巢炎。
多囊卵巢综合征是由于下丘脑垂体功能失常造成的，下丘脑垂体功能失常会使卵巢合成甾体激素异常，从而引起慢性无排卵。与遗传因素也有密切的关系，如果母亲患有多囊卵巢综合征，女儿可能会遗传这种基因，发病率相对较高。
卵巢早衰有家族遗传倾向，也就是说这种卵巢疾病可能是由遗传因素造成的。部分人发生卵巢早衰，是因为长时间抽烟喝酒所致，香烟以及酒精均会对卵巢造成不良刺激，久之便会导致卵巢功能衰退，诱发卵巢早衰。
