引起女性习惯性流产的原因包括子宫因素、内分泌因素、遗传因素、免疫因素以及其他因素等等。对于习惯性流产，女性首先要找出它发生的具体原因，之后再进行针对性处理，以避免流产的再次发生。
1.子宫因素：女性出现子宫畸形、子宫血液供应不佳、子宫内膜类固醇受体缺乏、黏膜下子宫肌瘤、宫腔粘连以及宫颈内口功能不全等，都可能导致习惯性流产。
2.内分泌因素：女性在怀孕之后激素变化会十分明显，而激素的变化对于妊娠的维持又起到了重要作用。如果女性发生内分泌功能失调，比如原发性绒毛膜促性腺激素分泌不足、原发性孕激素分泌不足以及肾上腺皮质、甲状腺、胰腺等功能障碍，也都会影响到卵巢及黄体的形成，从而影响到胚胎的正常发育，引起流产。
3.遗传因素：女性发生习惯性流产还可能因胚胎的染色体结构与数目发生异常导致。发生这种情况大多是由于夫妻中有一方或者双方都出现了染色体异常引起的，此外，一些夫妻双方可能都没有染色体异常的现象，也不排除胎儿出现染色体异常。
4.免疫因素：如果出现ABO血型不合，胎儿可发生溶血症，它的发生率要比Rh型血型不合的发生率更高。ABO血型不合主要表现为新生儿早期黄疸，但也有一些会引起习惯性流产。
5.其他因素：孕妇如果患有系统性红斑狼疮、慢性肾功能不全以及阴道、宫颈感染了某种真菌、病毒等，也都可能引起流产。此外，慢性胎盘功能不全也会导致晚期流产、死胎等。孕妇所生活的环境不佳，比如长期处于噪音、高温等环境，或者长期接触有毒化学物质，都可能引起习惯性流产。
