中性粒细胞数目偏低可能是细菌或病毒感染所致，如革兰阴性杆菌和流感病毒等。也可能是缺铁性贫血、巨幼细胞性贫血等血液系统疾病引起的，或是接触化学或放射类有毒物质所致。
中性粒细胞数目偏低在临床上被称为粒细胞缺乏症，往往提示感染性疾病产生，体内可能存在有炎症反应。一般考虑是受到了革兰阴性杆菌或伤寒杆菌、副伤寒杆菌感染，或是病毒感染，常见的有流感病毒、疱疹病毒及巨细胞病毒，可能会出现流感、水痘、风疹、病毒性肝炎等疾病。
血液系统疾病会导致中性粒细胞数目发生异常，存在明显偏低情况，如严重缺铁性贫血、巨幼细胞性贫血、再生障碍性贫血及恶性组织细胞病等。
若长期性接触苯、汞及铅等有毒化学物质，或受到放射性核素及X线刺激，会导致中性粒细胞合成障碍，引起水平偏低情况。
