扁桃体对人体的防御作用很弱，扁桃体切除后不会影响人的抵抗力。手术切除扁桃体后会有不适感，如术后会形成一些瘢痕，瘢痕牵拉容易造成吞咽或说话时的异物感。部分扁桃体上存在一些腺体，腺体滋润咽腔，扁桃体切除后，部分敏感患者存在嗓子干燥现象。
1、操作过程中的风险：扁桃体血管丰富，手术中最大的风险是出血，但目前医疗条件较好，一般采用全身麻醉，即使出血，也能及时有效治疗。
2、术后短期影响：扁桃体切除术后短期（1～2周）反应主要包括疼痛、吞咽困难、出血等风险。一般来说，这些风险不大，主要通过饮食控制，使用抗生素来预防。
3、术后远期影响：扁桃体是咽喉的重要免疫器官。虽然切除后对整个免疫系统影响不大，但对咽部局部黏膜免疫可能有一定影响，并可能出现咽干和不适。扁桃体慢性炎症虽有咽喉异物感，但扁桃体切除术后可引起咽部淋巴滤泡代偿性增生和肥大，导致咽部异物感迟钝或加重。
如果扁桃体炎或扁桃体在其他器官引起了病变，扁桃体表面有良性肿瘤，可以进行扁桃体切除术。在这种情况下，扁桃体对身体的危害大于好处，严格按照指示进行操作是没有问题的。扁桃体切除术能显着提高慢性扁桃体炎患者的生活质量。扁桃体切除术和腺样体切除术对儿童免疫功能影响不大，正确的术后护理有助于患者早日康复。
