由于抗生素全身药物在前列腺中难以达到有效浓度，影响疗效，因此出现了直接将抗生素注入前列腺的治疗方法。其具体方法是选择对症抗生素，单独或共同应用，在会阴部直接注入的列腺部分，或者在超声波引导下直接注入前列腺，每周1~2次，10次为疗程。
这种治疗方法的主要优点是药物直接注入前列腺，容易扩散，达到有效的抗菌浓度，不仅可以杀死注射部位的细菌，还可以杀死周围组织的细菌，药物部分吸收血液，尿道和其他部位的感染
但也有难以克服的缺点。主要是
(1)前列腺部位深，直接注射不容易，穿刺会损伤周围组织，引起血尿。
(2)穿刺会引起疼痛不适，反复进行的话，患者很难接受。
(3)经皮肤或直肠穿刺，细菌可带人，引起前列腺重复感染。
(4)多次穿刺可引起前列腺纤维组织增生、前列腺硬化，肛门诊断时前列腺内接触硬结，接触硬质前列腺。纤维组织增生会使病灶分离包围，抗生素难以渗透，前列腺液排出困难。因此，在选择这种治疗方法时必须小心。只有当其他方法无效时，才能考虑这种方法。穿刺不应该太频繁。每周穿刺1-2次。疗程不应该太长，应该控制在1-2月左右。
